حول سلسلة انتهاكات قانونية قام بها أفراد لغايات شخصية, تؤدي إلى زعزعة الاستقرار في مدينة طوكيو اليابانية، يقودها شخص في محاولة منه للانتقام، عقب إثبات تورطه بعملية تفجير ضخمة، أودت بحياة عشرات الضحايا من رجال الشرطة، وسط المدينة خلال حدث سنوي بارز. يبدأ المحقق كونان مهمته بتبرأة المشتبه به الرئيسي في القضية، ثم يتنقل إلى ملاحقة الشخص الذي يقف وراء هذه الجرائم، تتسارع الأحداث أكثر، عندما يقوم المجرم باختراق نظام وكالة نازو الفضائية لإسقاط مسبار فوق مركز الشرطة في طوكيو، وهنا تتشابك الخيوط، وتصعُب المهمة أمام المحقق كونان، لإيجاد المجرم والإيقاع به. قصة شيقة ومغامرات تحبس الأنفاس يخوضها كونان برفقة أمورو، والدكتور أغاسا وشخصيات مختلفة يُغير بعضها مجرى الأحداث بشكل مفاجئ في اللحظات الأخيرة
